Mängurid edendasid taaskord teadust
Toimetas Jaan-Juhan OidermaaTuhanded mängijad on populaarse kodanikuteadust edendava bioloogiliste molekulide voltimismängu Foldit vahendusel aidanud taaskord teadlastel lahendada neid juba mitu aastat vaevanud probleemi, mille tulemusel suudeti ensüümi reageerimisvalmidust kümned kordi tõsta.Foldit ei ole päris tavaline mäng. Algselt oli lihtsalt tegu programmiga, mille kaudu loovutasid selle kasutajad osa oma arvutite arvutus-võimsusest teaduse hüvanguks. Peagi tahtis terve hulk neist hakata tegelema sellega, millega nende arvutid – otsida võimalusi, kuidas erinevaid proteiine võimalikult tihedalt kokku pakkida saab. Selgus, et nad olid arvutitest tunduvalt edukamad. Arvutid ei ole geomeetriat nõudvates ülesannetes väga head.   Eelmise aasta septembris viis see esimese teadusajakirjas ilmunud uurimuse avaldamiseni.Tänase seisuga on mänguga liitunud 240 000 inimest, kellest pidevalt aktiivsed on 2200. Mil juba erinevate valkude poolt kasutatavate kolmedimensiooniliste origami võtete leidmine võib olla mõningal juhul keerukas, otsustas grupp teadlasi mängijate nupukust uuel tasemel kontrollida. Washingtoni ülikoolis resideeriv biokeemik David Baker lisas mängu ülesanded, mille eesmärgiks oli leida teatud ensüümi enim reaktsiooni kiirendav struktuur. Ensüüm leiab rakendust moodsa keemiatööstuse tööhobusteks olevates Diels-Alderi reaktsioonides.Hoolimata reaktsioonide olulisusest on suudetud leida vaid väheseid valke, millega neid kiiremaks muuta saab. Üle-eelmisel aastal teatas Baker, et on suutnud puhtalt arvutuslikult leida ensüümi, mis selleks võimeline on. Siiski ei olnud see ideaalne. Loodud proteiini kuju polnud reaktsioonideks just mitte kõige sobivam. Selle omaduste parandamiseks sobiva struktuuri leidmiseks anti Foldit'i mängijatele kaks ülesannet.Esimeses paluti disainida ühele ensüümi aminohapeteketile kuju, mille tulemusena kasvaks kokkupuute pind reaktsioonis osalevate ainete kokkupuutepind. Teises pidid mängijad otsima võimalust, kuidas seda võimalikult stabiilseks muuta. Esimesele ülesandele saadud pea 70 000 lahenduse abil suudeti leida ensüümile kuju, millega kasvas selle reageerimisvalmidus sajakordselt. Teisele mõistatusele leiti ligikaudu 110 000 võimalikku lahendust. Viimaseid kombineerides tõstsid teadlased tööstuslikuks kasutamiseks sobiliku valgu aktiivsust kaheksateistkordselt.Loodud lahendus kujutab endas taaskord huvitavat teaduse ning kodanikuteaduse kokkupuutepunkti. Mängijate abiga suudeti lahendada juba mitu aastat teadlasi vaevanud probleem. Samal ajal ei oleks see olnud võimalik ilma probleemi püstitanud teadlaste ekspertiisita. Enamik saadetud lahenduste tulemuseks oli hoopis ensüüm, mille reageerimisvalmidus oli originaalist hoopis väiksem. Siiski vähendas see kordades võimalike lahenduste hulka.Kuigi Diels-Alder'i reaktsioonidele, kus ensüümi kasutada saaks, hetkel laiaulatuslikku rakendust ei leidu, tõestab uurimus, et Foldit on selletaolisteks ülesanneteks sobiv. Järgmisena plaanibki Baker lisada mängu märksa praktilisemaid probleeme. Tulemusena võivad näiteks valmida praegusest tunduvalt efektiivsemad haiguste kulgu pidurdavad inhibiitorid.Töörühma uurimus ilmus 22. jaanuaril ajakirjas Nature Biotechology .
