Arvuti kontrollib pagaripärmi geene
 Toimetas Kirsikka Kurg    Šveitsi teadlastel on õnnestunud moodustada tagasisidering tavalise pagaripärmi ja arvuti vahel, mille abil saab sisse ja välja lülitada kindlaid geene. Selle uuringu tulemused tulevad kasuks mitmetes bioloogiliste uuringutes ja aitavad teadlastel paremini mõista raku signalisatsiooni. Arvuti ja mingi organismi vaheline ühendus võib viia võimaluseni juhtida erinevaid bioloogilisi protsesse, tootmaks näiteks biokütust.    John Lygeros ja tema meeskond alustasid oma uuringuid pärmiga Saccharomyces cerevisiae, mida tavalised inimesed tunnevad pagaripärmi nime all.    Aastal 2002 ajakirjas Nature Biotechnology avaldatud uurimusest on teada, et kui S. cerevisiae eksponeerida valgusele, muudab temas olev molekul nimega fütokroom vormi. Punase valguse mõjul läheb proteiini tootmine oma aktiivsesse vormi, sügavama punase korral lülitatakse jälle välja. Sedasi saab käivitada ja peatada geneetilist protsessi, mille tulemuseks on fütokroomi produktsioon.    Sama teadmist kasutasid Šveitsi teadlased ka oma töös. Kontrollimaks, kas pärm toodab proteiini vastuseks geeni sisse lülitamisele või mitte, kasutati selle jälitamiseks fluorestseeruvat nn reporter molekuli.    See andis uurijatele aga täieliku kontrolli. Punase valguse särades õnnestus jälgida, kui suur osa pärmi populatsioonist ekspresseeris fütokroomi kodeerivat geeni. Sügavama punase valgusega sai need geenid jälle välja lülitada.    Lygerose kinnitusel pole tegu lihtsalt lülitiga. Teadlase sõnul on tegemist küllalt keerulise katsega, kuna lisaks fluorestseeruvale reporterile tuleb tegeleda veel poole tosina muu keemilise reaktsiooniga, mis on protsessi kaasatud.     Teadlaste hinnangul on raske luua sünteetilisi ahelaid isegi robustsete ülesannete jaoks rakus, mistõttu on lootust, et uus meetod suudab välise signaali abil seda protsessi veidi paremini kontrollida. Tulevikus võiks sarnasel meetodil olla võimalik toota näiteks biokütust või antibiootikume.    Vaata veel: Commanding Yeast Genes With Computers (RedOrbit) 
