Mammutite genoom sai järjestatud
Esimene mammutite genoomi mustand avaldati juba 2008. aastal. Paraku polnud see piisavalt täpne, et usaldusväärselt öelda, kuidas erineb see näiteks aasia elevantide omast. Pärilikkusaine killustumine on paratamatu. Eelnevatele teadmistele tuginedes on vahepeal muu hulgas uuritud lähemalt genoomi piirkondi, mis on seotud karvakasvu ja vere hapniku transpordiga. Kuigi mõningate väliste erinevuste põhjused said sellega selgemaks, puudus tervikpilt. Hiljuti veebikeskkonnas bioRxiv avaldatud töös kirjeldab Chicago ülikooli evolutsioonigeneetik Vincet Lynch kahe mammuti ja kolme aasia elevandi genoomi järjestamist. Vaatluse alla võetud mammutid hukkusid vastavalt 20 ja 60 tuhat aastat tagasi. Töörühm leidis, et mammuteid eristab nende lähisugulastest ligikaudu 1,4 miljonit genoomis toimunud asendust. Kokku mõjutasid nukleotiidide vahetused 1600 valke kodeerivat geeni. Eelnevate tööde võib oletada, et need on seotud muu hulgas ööpäevarütmide, karvakasvu, ainevahetuse kiiruse, temperatuuri tajumise ja rasva talletamisega. Sarnaselt mõni kuu varem ilmunud tööle otsustas Lynch lisaks uurida, kuidas muudavad genoomi alusel sünteesitud nukleotiidijärjestustest rakkude talitlust. Kui toona lisati mammutite pärilikkusainet elevantide genoomi, siis seekord tehti katseid inimrakkudega. Lynch leidis, et temperatuuri tajumise ja karvakasvuga seostatava geeni TRPV3 asendamine mammutite vastava pärilikkusaine lõiguga vähendas nende tundlikkust külma suhtes. Järgmise sammuna plaanib töörühm Lynch uurida geeni mõju elevantide indutseeritud pluripotentsetes tüvirakkudes. Sarnaselt embrüonaalsetele tüvirakkudele suudavad need areneda pea ükskõik millisteks keharakkudeks. Nõnda võimaldaks see uurida, kuidas avaldus geen mammutite erinevates kudedes. Mammutite täielik genoom võib anda juhiseid ka mammutite ühel või teisel kujul ellu äratamisele. Hetkel tegelevad sellega maailmas vähemalt kolm sõltumatut töörühma. Samuti on spekuleeritud, et mammutite geenid võiksid kasvatada elevantide külmataluvust, mis võimaldaks laiendada nende leviala ja loomi sellega väljasuremise eest kaitsta.
